SFDC：外部ID項目と自動採番項目について

データローダで既存データの判定を行い新規または更新を切り分けて登録する場合は、外部ID項目を用意してUPSERT処理を行うことで対応可能です。ただし、自動採番項目はサポートされていないので注意してください。(数式項目も同様に対応外だったはず)

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自動採番項目をキーにしたい場合は、Apexトリガ / ワークフロールール / プロセスビルダーなどをつかってデータ更新時にテキスト型の項目に値をセットするようにしておけば、自動採番の値と同じ値が保持されたテキスト型項目を用でき、外部キーとして利用できると思います。